Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB1P14653 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB1P14653 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms