Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM1P13688 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEACAM1P13688 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM1P13688 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms