Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCP12931 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCP12931 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCP12931 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCP12931 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCP12931 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRCP12931 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCP12931 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCP12931 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCP12931 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRCP12931 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRCP12931 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCP12931 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCP12931 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRCP12931 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRCP12931 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCP12931 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCP12931 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCP12931 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCP12931 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCP12931 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRCP12931 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRCP12931 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCP12931 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCP12931 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCP12931 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCP12931 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRCP12931 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRCP12931 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCP12931 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCP12931 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRCP12931 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCP12931 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCP12931 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRCP12931 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRCP12931 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCP12931 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCP12931 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCP12931 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCP12931 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCP12931 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCP12931 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRCP12931 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCP12931 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCP12931 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCP12931 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCP12931 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCP12931 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRCP12931 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRCP12931 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCP12931 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCP12931 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCP12931 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCP12931 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCP12931 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRCP12931 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCP12931 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCP12931 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRCP12931 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRCP12931 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCP12931 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCP12931 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCP12931 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCP12931 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms