Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SRCP12931 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SRCP12931 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SRCP12931 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SRCP12931 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SRCP12931 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SRCP12931 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SRCP12931 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SRCP12931 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SRCP12931 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SRCP12931 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SRCP12931 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SRCP12931 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SRCP12931 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SRCP12931 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SRCP12931 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SRCP12931 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SRCP12931 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SRCP12931 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SRCP12931 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SRCP12931 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SRCP12931 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SRCP12931 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SRCP12931 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SRCP12931 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SRCP12931 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SRCP12931 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SRCP12931 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SRCP12931 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SRCP12931 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SRCP12931 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SRCP12931 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SRCP12931 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SRCP12931 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SRCP12931 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SRCP12931 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SRCP12931 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SRCP12931 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SRCP12931 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRCP12931 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCP12931 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRCP12931 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SRCP12931 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SRCP12931 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRCP12931 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SRCP12931 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRCP12931 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRCP12931 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRCP12931 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SRCP12931 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SRCP12931 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRCP12931 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SRCP12931 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRCP12931 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRCP12931 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRCP12931 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SRCP12931 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SRCP12931 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SRCP12931 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRCP12931 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SRCP12931 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRCP12931 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRCP12931 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRCP12931 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRCP12931 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SRCP12931 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SRCP12931 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRCP12931 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRCP12931 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRCP12931 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRCP12931 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCP12931 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCP12931 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCP12931 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCP12931 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCP12931 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCP12931 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCP12931 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCP12931 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCP12931 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCP12931 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCP12931 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SRCP12931 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRCP12931 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SRCP12931 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCP12931 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRCP12931 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRCP12931 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRCP12931 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRCP12931 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRCP12931 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRCP12931 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRCP12931 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRCP12931 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRCP12931 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRCP12931 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRCP12931 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRCP12931 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRCP12931 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRCP12931 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms