Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GNAT1P11488 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GNAT1P11488 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms