Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.74
GNAT1P11488 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
GNAT1P11488 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GNAT1P11488 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GNAT1P11488 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GNAT1P11488 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GNAT1P11488 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GNAT1P11488 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
GNAT1P11488 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GNAT1P11488 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GNAT1P11488 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GNAT1P11488 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GNAT1P11488 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GNAT1P11488 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GNAT1P11488 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GNAT1P11488 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GNAT1P11488 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GNAT1P11488 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GNAT1P11488 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GNAT1P11488 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GNAT1P11488 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GNAT1P11488 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GNAT1P11488 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GNAT1P11488 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GNAT1P11488 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GNAT1P11488 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GNAT1P11488 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GNAT1P11488 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GNAT1P11488 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GNAT1P11488 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GNAT1P11488 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GNAT1P11488 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GNAT1P11488 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GNAT1P11488 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GNAT1P11488 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GNAT1P11488 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GNAT1P11488 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GNAT1P11488 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GNAT1P11488 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GNAT1P11488 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GNAT1P11488 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GNAT1P11488 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GNAT1P11488 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GNAT1P11488 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GNAT1P11488 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GNAT1P11488 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GNAT1P11488 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GNAT1P11488 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GNAT1P11488 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GNAT1P11488 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GNAT1P11488 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GNAT1P11488 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GNAT1P11488 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GNAT1P11488 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
GNAT1P11488 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GNAT1P11488 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GNAT1P11488 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GNAT1P11488 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GNAT1P11488 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
GNAT1P11488 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GNAT1P11488 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GNAT1P11488 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GNAT1P11488 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GNAT1P11488 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GNAT1P11488 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GNAT1P11488 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GNAT1P11488 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GNAT1P11488 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GNAT1P11488 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GNAT1P11488 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GNAT1P11488 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GNAT1P11488 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GNAT1P11488 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GNAT1P11488 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GNAT1P11488 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GNAT1P11488 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GNAT1P11488 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GNAT1P11488 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GNAT1P11488 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GNAT1P11488 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GNAT1P11488 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GNAT1P11488 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GNAT1P11488 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GNAT1P11488 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GNAT1P11488 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GNAT1P11488 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GNAT1P11488 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GNAT1P11488 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GNAT1P11488 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GNAT1P11488 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GNAT1P11488 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GNAT1P11488 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GNAT1P11488 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GNAT1P11488 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GNAT1P11488 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GNAT1P11488 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GNAT1P11488 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GNAT1P11488 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GNAT1P11488 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GNAT1P11488 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms