Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF1P10914 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF1P10914 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF1P10914 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF1P10914 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF1P10914 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF1P10914 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF1P10914 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF1P10914 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF1P10914 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF1P10914 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF1P10914 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF1P10914 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF1P10914 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF1P10914 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF1P10914 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF1P10914 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF1P10914 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF1P10914 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF1P10914 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF1P10914 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF1P10914 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF1P10914 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF1P10914 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF1P10914 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF1P10914 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF1P10914 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF1P10914 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF1P10914 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF1P10914 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF1P10914 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF1P10914 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF1P10914 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF1P10914 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF1P10914 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF1P10914 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF1P10914 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF1P10914 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF1P10914 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF1P10914 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF1P10914 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF1P10914 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF1P10914 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF1P10914 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF1P10914 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF1P10914 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF1P10914 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF1P10914 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF1P10914 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF1P10914 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF1P10914 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF1P10914 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF1P10914 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF1P10914 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF1P10914 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF1P10914 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF1P10914 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF1P10914 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF1P10914 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF1P10914 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF1P10914 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF1P10914 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF1P10914 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF1P10914 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF1P10914 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF1P10914 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF1P10914 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRF1P10914 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRF1P10914 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms