Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PARP1P09874 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP1P09874 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP1P09874 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP1P09874 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PARP1P09874 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP1P09874 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP1P09874 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP1P09874 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP1P09874 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PARP1P09874 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP1P09874 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP1P09874 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP1P09874 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP1P09874 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP1P09874 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP1P09874 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP1P09874 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP1P09874 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP1P09874 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP1P09874 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP1P09874 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP1P09874 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP1P09874 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP1P09874 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP1P09874 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP1P09874 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP1P09874 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP1P09874 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP1P09874 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP1P09874 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP1P09874 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP1P09874 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP1P09874 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP1P09874 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP1P09874 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP1P09874 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP1P09874 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP1P09874 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP1P09874 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP1P09874 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP1P09874 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PARP1P09874 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PARP1P09874 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP1P09874 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP1P09874 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP1P09874 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP1P09874 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP1P09874 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP1P09874 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP1P09874 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP1P09874 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP1P09874 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP1P09874 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP1P09874 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP1P09874 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP1P09874 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP1P09874 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP1P09874 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP1P09874 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP1P09874 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP1P09874 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP1P09874 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP1P09874 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP1P09874 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP1P09874 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP1P09874 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP1P09874 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP1P09874 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PARP1P09874 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP1P09874 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP1P09874 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP1P09874 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP1P09874 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms