Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSF1RP07333 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSF1RP07333 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CSF1RP07333 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CSF1RP07333 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSF1RP07333 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms