Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LDHBP07195 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LDHBP07195 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LDHBP07195 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LDHBP07195 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LDHBP07195 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LDHBP07195 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LDHBP07195 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LDHBP07195 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LDHBP07195 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHBP07195 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHBP07195 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHBP07195 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHBP07195 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHBP07195 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LDHBP07195 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LDHBP07195 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LDHBP07195 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LDHBP07195 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LDHBP07195 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LDHBP07195 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHBP07195 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHBP07195 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHBP07195 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHBP07195 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LDHBP07195 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHBP07195 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHBP07195 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHBP07195 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHBP07195 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHBP07195 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHBP07195 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LDHBP07195 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHBP07195 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHBP07195 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHBP07195 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHBP07195 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHBP07195 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHBP07195 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LDHBP07195 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHBP07195 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHBP07195 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHBP07195 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHBP07195 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHBP07195 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHBP07195 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LDHBP07195 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LDHBP07195 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LDHBP07195 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LDHBP07195 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LDHBP07195 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LDHBP07195 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LDHBP07195 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LDHBP07195 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LDHBP07195 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LDHBP07195 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LDHBP07195 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHBP07195 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHBP07195 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHBP07195 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHBP07195 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHBP07195 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LDHBP07195 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LDHBP07195 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHBP07195 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHBP07195 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHBP07195 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LDHBP07195 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHBP07195 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LDHBP07195 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHBP07195 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHBP07195 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LDHBP07195 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHBP07195 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LDHBP07195 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHBP07195 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDHBP07195 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHBP07195 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHBP07195 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHBP07195 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHBP07195 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHBP07195 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDHBP07195 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDHBP07195 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDHBP07195 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LDHBP07195 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHBP07195 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHBP07195 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHBP07195 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHBP07195 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHBP07195 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDHBP07195 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHBP07195 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHBP07195 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHBP07195 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHBP07195 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LDHBP07195 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDHBP07195 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDHBP07195 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDHBP07195 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms