Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
LDHBP07195 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
LDHBP07195 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
LDHBP07195 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
LDHBP07195 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
LDHBP07195 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
LDHBP07195 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
LDHBP07195 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
LDHBP07195 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LDHBP07195 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
LDHBP07195 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LDHBP07195 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
LDHBP07195 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
LDHBP07195 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LDHBP07195 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LDHBP07195 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LDHBP07195 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LDHBP07195 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
LDHBP07195 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
LDHBP07195 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
LDHBP07195 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
LDHBP07195 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
LDHBP07195 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
LDHBP07195 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LDHBP07195 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LDHBP07195 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LDHBP07195 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LDHBP07195 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LDHBP07195 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LDHBP07195 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LDHBP07195 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LDHBP07195 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LDHBP07195 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LDHBP07195 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LDHBP07195 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
LDHBP07195 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LDHBP07195 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LDHBP07195 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
LDHBP07195 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LDHBP07195 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LDHBP07195 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LDHBP07195 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
LDHBP07195 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LDHBP07195 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LDHBP07195 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LDHBP07195 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
LDHBP07195 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LDHBP07195 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LDHBP07195 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LDHBP07195 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LDHBP07195 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
LDHBP07195 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LDHBP07195 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LDHBP07195 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LDHBP07195 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LDHBP07195 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LDHBP07195 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LDHBP07195 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LDHBP07195 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LDHBP07195 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LDHBP07195 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LDHBP07195 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LDHBP07195 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LDHBP07195 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
LDHBP07195 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LDHBP07195 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
LDHBP07195 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LDHBP07195 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LDHBP07195 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LDHBP07195 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LDHBP07195 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
LDHBP07195 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
LDHBP07195 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
LDHBP07195 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
LDHBP07195 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LDHBP07195 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
LDHBP07195 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LDHBP07195 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LDHBP07195 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LDHBP07195 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LDHBP07195 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LDHBP07195 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LDHBP07195 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LDHBP07195 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LDHBP07195 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LDHBP07195 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LDHBP07195 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LDHBP07195 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
LDHBP07195 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LDHBP07195 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LDHBP07195 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
LDHBP07195 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LDHBP07195 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LDHBP07195 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LDHBP07195 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LDHBP07195 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LDHBP07195 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LDHBP07195 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LDHBP07195 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LDHBP07195 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms