Protein–RNA interactions for Protein: P01210

PENK, Proenkephalin-A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PENKP01210 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PENKP01210 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PENKP01210 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PENKP01210 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PENKP01210 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PENKP01210 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PENKP01210 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PENKP01210 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PENKP01210 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PENKP01210 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PENKP01210 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PENKP01210 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PENKP01210 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PENKP01210 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PENKP01210 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PENKP01210 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PENKP01210 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PENKP01210 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PENKP01210 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PENKP01210 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PENKP01210 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PENKP01210 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PENKP01210 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PENKP01210 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PENKP01210 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PENKP01210 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PENKP01210 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PENKP01210 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PENKP01210 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PENKP01210 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PENKP01210 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PENKP01210 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PENKP01210 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PENKP01210 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PENKP01210 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PENKP01210 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PENKP01210 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PENKP01210 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PENKP01210 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PENKP01210 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PENKP01210 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PENKP01210 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PENKP01210 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PENKP01210 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PENKP01210 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PENKP01210 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PENKP01210 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PENKP01210 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PENKP01210 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PENKP01210 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PENKP01210 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PENKP01210 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PENKP01210 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PENKP01210 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PENKP01210 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PENKP01210 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PENKP01210 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PENKP01210 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PENKP01210 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PENKP01210 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PENKP01210 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PENKP01210 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PENKP01210 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PENKP01210 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PENKP01210 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PENKP01210 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PENKP01210 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PENKP01210 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PENKP01210 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PENKP01210 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PENKP01210 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PENKP01210 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PENKP01210 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PENKP01210 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PENKP01210 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PENKP01210 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PENKP01210 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PENKP01210 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PENKP01210 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PENKP01210 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PENKP01210 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PENKP01210 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms