Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX18O95935 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX18O95935 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX18O95935 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX18O95935 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX18O95935 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX18O95935 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX18O95935 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX18O95935 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX18O95935 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX18O95935 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX18O95935 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX18O95935 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBX18O95935 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX18O95935 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX18O95935 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX18O95935 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX18O95935 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX18O95935 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX18O95935 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBX18O95935 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX18O95935 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX18O95935 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX18O95935 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX18O95935 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX18O95935 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX18O95935 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBX18O95935 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX18O95935 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX18O95935 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX18O95935 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX18O95935 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX18O95935 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBX18O95935 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX18O95935 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX18O95935 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX18O95935 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX18O95935 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBX18O95935 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX18O95935 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX18O95935 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX18O95935 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX18O95935 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBX18O95935 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX18O95935 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX18O95935 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX18O95935 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX18O95935 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBX18O95935 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX18O95935 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX18O95935 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX18O95935 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX18O95935 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX18O95935 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TBX18O95935 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX18O95935 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX18O95935 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX18O95935 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBX18O95935 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TBX18O95935 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX18O95935 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX18O95935 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX18O95935 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX18O95935 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX18O95935 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TBX18O95935 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TBX18O95935 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TBX18O95935 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX18O95935 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX18O95935 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TBX18O95935 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms