Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA4FO95754 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4FO95754 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4FO95754 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4FO95754 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms