Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDH8O95206 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDH8O95206 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms