Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QL1O75973 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL1O75973 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL1O75973 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms