Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA10O75578 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA10O75578 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms