Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX11O75558 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX11O75558 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX11O75558 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX11O75558 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX11O75558 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX11O75558 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX11O75558 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX11O75558 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX11O75558 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX11O75558 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX11O75558 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX11O75558 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX11O75558 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX11O75558 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX11O75558 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX11O75558 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX11O75558 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX11O75558 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX11O75558 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX11O75558 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX11O75558 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX11O75558 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX11O75558 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX11O75558 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STX11O75558 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX11O75558 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STX11O75558 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX11O75558 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX11O75558 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX11O75558 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STX11O75558 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STX11O75558 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX11O75558 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX11O75558 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX11O75558 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX11O75558 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX11O75558 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX11O75558 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX11O75558 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX11O75558 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX11O75558 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX11O75558 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX11O75558 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX11O75558 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX11O75558 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX11O75558 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX11O75558 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STX11O75558 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms