Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA4O75335 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA4O75335 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms