Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSVO60911 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSVO60911 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSVO60911 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSVO60911 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSVO60911 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSVO60911 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSVO60911 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSVO60911 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSVO60911 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSVO60911 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSVO60911 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSVO60911 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSVO60911 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSVO60911 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSVO60911 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSVO60911 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSVO60911 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSVO60911 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSVO60911 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSVO60911 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSVO60911 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSVO60911 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSVO60911 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSVO60911 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSVO60911 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSVO60911 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSVO60911 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSVO60911 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSVO60911 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSVO60911 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSVO60911 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSVO60911 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSVO60911 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSVO60911 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSVO60911 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSVO60911 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSVO60911 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSVO60911 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSVO60911 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms