Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATCO43716 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATCO43716 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GATCO43716 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GATCO43716 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GATCO43716 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GATCO43716 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GATCO43716 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GATCO43716 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GATCO43716 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GATCO43716 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GATCO43716 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GATCO43716 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GATCO43716 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GATCO43716 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GATCO43716 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GATCO43716 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GATCO43716 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GATCO43716 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GATCO43716 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GATCO43716 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GATCO43716 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GATCO43716 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GATCO43716 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GATCO43716 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GATCO43716 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATCO43716 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATCO43716 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATCO43716 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATCO43716 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GATCO43716 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATCO43716 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GATCO43716 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GATCO43716 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GATCO43716 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GATCO43716 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GATCO43716 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATCO43716 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATCO43716 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATCO43716 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATCO43716 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATCO43716 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GATCO43716 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATCO43716 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATCO43716 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATCO43716 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATCO43716 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GATCO43716 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GATCO43716 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GATCO43716 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms