Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID2O43424 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID2O43424 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID2O43424 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID2O43424 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID2O43424 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRID2O43424 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRID2O43424 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRID2O43424 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID2O43424 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID2O43424 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID2O43424 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID2O43424 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID2O43424 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRID2O43424 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRID2O43424 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRID2O43424 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRID2O43424 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRID2O43424 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRID2O43424 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRID2O43424 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRID2O43424 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRID2O43424 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID2O43424 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID2O43424 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID2O43424 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID2O43424 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID2O43424 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID2O43424 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRID2O43424 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRID2O43424 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID2O43424 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID2O43424 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID2O43424 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID2O43424 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRID2O43424 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRID2O43424 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID2O43424 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID2O43424 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID2O43424 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID2O43424 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID2O43424 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID2O43424 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRID2O43424 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRID2O43424 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms