Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRID2O43424 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRID2O43424 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GRID2O43424 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRID2O43424 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
GRID2O43424 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRID2O43424 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRID2O43424 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRID2O43424 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRID2O43424 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GRID2O43424 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GRID2O43424 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GRID2O43424 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRID2O43424 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRID2O43424 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GRID2O43424 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRID2O43424 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GRID2O43424 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GRID2O43424 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRID2O43424 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GRID2O43424 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GRID2O43424 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GRID2O43424 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRID2O43424 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRID2O43424 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRID2O43424 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRID2O43424 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRID2O43424 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRID2O43424 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRID2O43424 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRID2O43424 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRID2O43424 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRID2O43424 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRID2O43424 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRID2O43424 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRID2O43424 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRID2O43424 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRID2O43424 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRID2O43424 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRID2O43424 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRID2O43424 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GRID2O43424 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GRID2O43424 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GRID2O43424 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRID2O43424 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRID2O43424 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRID2O43424 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRID2O43424 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRID2O43424 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRID2O43424 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRID2O43424 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRID2O43424 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRID2O43424 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRID2O43424 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GRID2O43424 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GRID2O43424 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GRID2O43424 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRID2O43424 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRID2O43424 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRID2O43424 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRID2O43424 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRID2O43424 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRID2O43424 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRID2O43424 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRID2O43424 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRID2O43424 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRID2O43424 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GRID2O43424 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRID2O43424 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRID2O43424 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRID2O43424 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GRID2O43424 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRID2O43424 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRID2O43424 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRID2O43424 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRID2O43424 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRID2O43424 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRID2O43424 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRID2O43424 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRID2O43424 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRID2O43424 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRID2O43424 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRID2O43424 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRID2O43424 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRID2O43424 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRID2O43424 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRID2O43424 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRID2O43424 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRID2O43424 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRID2O43424 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRID2O43424 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRID2O43424 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRID2O43424 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRID2O43424 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRID2O43424 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRID2O43424 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRID2O43424 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRID2O43424 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRID2O43424 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRID2O43424 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms