Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 PPP6R1-206ENST00000591323 848 ntTSL 312.38□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 413.74□□□□□ -0.219e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.239e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-203ENST00000517331 584 ntTSL 512.19□□□□□ -0.469e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.529e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-225ENST00000522890 581 ntTSL 511.42□□□□□ -0.589e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 411.34□□□□□ -0.599e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.659e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 410.66□□□□□ -0.79e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 410.1□□□□□ -0.799e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-204ENST00000517599 2918 ntTSL 29.97□□□□□ -0.819e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.879e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.879e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 59.57□□□□□ -0.889e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.939e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 59.14□□□□□ -0.959e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 CCM2-211ENST00000478582 937 ntTSL 321.16■□□□□ 0.986e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 CCM2-205ENST00000472223 981 ntTSL 313.54□□□□□ -0.246e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 CCM2-215ENST00000482714 1459 ntTSL 212.3□□□□□ -0.446e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 CCM2-217ENST00000492883 1061 ntTSL 210.98□□□□□ -0.656e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 CCM2-213ENST00000480658 1136 ntTSL 28.83□□□□□ -16e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 CCM2-210ENST00000478169 542 ntTSL 47.12□□□□□ -1.276e-11■■■■■ 38.6
RBFOX2O43251 ZMIZ2-211ENST00000480964 890 ntTSL 210.56□□□□□ -0.723e-11■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 413.55□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 54.73□□□□□ -1.657e-7■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 AL163953.1-201ENST00000436530 726 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.977e-9■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-18■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-18■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 36.79□□□□□ -1.324e-17■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 MARS-202ENST00000447721 1328 ntTSL 214.43□□□□□ -0.15e-31■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 MARS-204ENST00000545888 2979 ntTSL 512.38□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 38.5
RBFOX2O43251 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 38.4
RBFOX2O43251 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 38.4
RBFOX2O43251 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 38.4
RBFOX2O43251 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 38.4
RBFOX2O43251 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 38.4
RBFOX2O43251 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-14■■■■■ 38.4
RBFOX2O43251 EDC4-204ENST00000572221 5267 ntTSL 217.38■□□□□ 0.372e-12■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-12■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 EDC4-202ENST00000536072 2375 ntTSL 213.64□□□□□ -0.232e-12■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 EDC4-213ENST00000577028 747 ntTSL 413.41□□□□□ -0.262e-12■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 EDC4-207ENST00000573992 3934 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.852e-12■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 FAM107B-212ENST00000471815 899 ntTSL 28.57□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 FAM107B-221ENST00000487335 2317 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 FAM107B-207ENST00000442012 458 ntTSL 52.28□□□□□ -2.042e-8■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 NR2F6-202ENST00000596878 731 ntTSL 319.57■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.345e-21■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-21■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.65e-21■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 MAP2K3-208ENST00000496046 2089 ntTSL 510.53□□□□□ -0.725e-21■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 MAP2K3-204ENST00000395491 2401 ntTSL 210.29□□□□□ -0.765e-21■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.955e-21■■■■■ 38.3
RBFOX2O43251 DGKD-204ENST00000430834 5379 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 212.74□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MGAT4B-205ENST00000518778 1568 ntTSL 1 (best)17.56■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MGAT4B-213ENST00000520822 745 ntTSL 210.5□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MGAT4B-223ENST00000523382 778 ntTSL 38.21□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MGAT4B-214ENST00000520875 964 ntTSL 58.21□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MGAT4B-206ENST00000518867 732 ntTSL 57.02□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MGAT4B-204ENST00000518702 542 ntTSL 36.63□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MGAT4B-207ENST00000518980 983 ntTSL 56.38□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.19e-8■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 NRBP2-209ENST00000533093 3877 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 213.79□□□□□ -0.29e-8■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.589e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-214ENST00000495377 733 ntTSL 59.84□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-203ENST00000397303 1354 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-210ENST00000449924 1935 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-208ENST00000416721 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.19e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.199e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 R3HDM4-202ENST00000586080 537 ntTSL 416.8■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.028e-8■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 IFFO2-202ENST00000416166 1000 ntTSL 311.08□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 38.2
RBFOX2O43251 MIB2-224ENST00000508455 555 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 38.1
RBFOX2O43251 GALK2-208ENST00000559040 471 ntTSL 57.35□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 38.1
RBFOX2O43251 ADAM15-223ENST00000498481 1119 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 38.1
RBFOX2O43251 ADAM15-210ENST00000461234 1069 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 38.1
RBFOX2O43251 ADAM15-218ENST00000474709 731 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 38.1
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 129.4 ms