Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms