Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM200CA6NKL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM200CA6NKL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms