Protein–RNA interactions for Protein: A6NF01

POM121B, Putative nuclear envelope pore membrane protein POM 121B, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121BA6NF01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POM121BA6NF01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POM121BA6NF01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POM121BA6NF01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POM121BA6NF01 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms