Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAMKK2Q96RR4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAMKK2Q96RR4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms