Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRIM72Q6ZMU5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms