RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425687.5

TBXAS1-206, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TBXAS1, Length 2,080 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-206ENST00000425687 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.33■■■■■ 4.21
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TBXAS1-206ENST00000425687 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
TBXAS1-206ENST00000425687 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.31■■■■□ 3.08
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TBXAS1-206ENST00000425687 NACADO15069 1562 aa34.13■■■■□ 3.05
TBXAS1-206ENST00000425687 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.09■■■■□ 3.05
TBXAS1-206ENST00000425687 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.04■■■■□ 3.04
TBXAS1-206ENST00000425687 SCRIBQ14160 1630 aa33.4■■■□□ 2.94
TBXAS1-206ENST00000425687 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.39■■■□□ 2.94
TBXAS1-206ENST00000425687 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.13■■■□□ 2.89
TBXAS1-206ENST00000425687 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.06■■■□□ 2.88
TBXAS1-206ENST00000425687 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.06■■■□□ 2.88
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TBXAS1-206ENST00000425687 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.98■■■□□ 2.71
TBXAS1-206ENST00000425687 SMARCA4P51532 1647 aa31.96■■■□□ 2.71
TBXAS1-206ENST00000425687 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
TBXAS1-206ENST00000425687 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.92■■■□□ 2.7
TBXAS1-206ENST00000425687 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.9■■■□□ 2.7
TBXAS1-206ENST00000425687 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
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TBXAS1-206ENST00000425687 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.63■■■□□ 2.65
TBXAS1-206ENST00000425687 WIZO95785 1651 aa31.6■■■□□ 2.65
TBXAS1-206ENST00000425687 SMARCA2P51531 1590 aa31.57■■■□□ 2.64
TBXAS1-206ENST00000425687 NCAPD3P42695 1498 aa31.53■■■□□ 2.64
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TBXAS1-206ENST00000425687 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
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TBXAS1-206ENST00000425687 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.91■■■□□ 2.54
TBXAS1-206ENST00000425687 NESP48681 1621 aa30.72■■■□□ 2.51
TBXAS1-206ENST00000425687 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.64■■■□□ 2.49
TBXAS1-206ENST00000425687 CFTRP13569 1480 aa30.59■■■□□ 2.49
TBXAS1-206ENST00000425687 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.58■■■□□ 2.49
TBXAS1-206ENST00000425687 PRDM2Q13029 1718 aa30.36■■■□□ 2.45
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TBXAS1-206ENST00000425687 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.32■■■□□ 2.44
TBXAS1-206ENST00000425687 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.3■■■□□ 2.44
TBXAS1-206ENST00000425687 ERCC6Q03468 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
TBXAS1-206ENST00000425687 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.18■■■□□ 2.42
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TBXAS1-206ENST00000425687 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.04■■■□□ 2.4
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TBXAS1-206ENST00000425687 ABCC8Q09428 1581 aa29.99■■■□□ 2.39
TBXAS1-206ENST00000425687 WDR62O43379 1518 aa29.95■■■□□ 2.38
TBXAS1-206ENST00000425687 CUX1P39880 1505 aa29.9■■■□□ 2.38
TBXAS1-206ENST00000425687 TOPBP1Q92547 1522 aa29.89■■■□□ 2.38
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TBXAS1-206ENST00000425687 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
TBXAS1-206ENST00000425687 SYNJ1O43426 1573 aa29.83■■■□□ 2.37
TBXAS1-206ENST00000425687 TOP2BQ02880 1626 aa29.74■■■□□ 2.35
TBXAS1-206ENST00000425687 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.73■■■□□ 2.35
TBXAS1-206ENST00000425687 CUX2O14529 1486 aa29.72■■■□□ 2.35
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TBXAS1-206ENST00000425687 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.69■■■□□ 2.34
TBXAS1-206ENST00000425687 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.59■■■□□ 2.33
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TBXAS1-206ENST00000425687 IFT140Q96RY7 1462 aa29.51■■■□□ 2.31
TBXAS1-206ENST00000425687 TRIM41Q8WV44 630 aa29.48■■■□□ 2.31
TBXAS1-206ENST00000425687 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TBXAS1-206ENST00000425687 WDR97A6NE52 1622 aa29.43■■■□□ 2.3
TBXAS1-206ENST00000425687 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.4■■■□□ 2.3
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TBXAS1-206ENST00000425687 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
TBXAS1-206ENST00000425687 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.26■■■□□ 2.28
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TBXAS1-206ENST00000425687 PBRM1Q86U86 1689 aa29.13■■■□□ 2.25
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TBXAS1-206ENST00000425687 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.03■■■□□ 2.24
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TBXAS1-206ENST00000425687 ADAMTS12P58397 1594 aa28.93■■■□□ 2.22
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TBXAS1-206ENST00000425687 CHD1O14646 1710 aa28.84■■■□□ 2.21
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TBXAS1-206ENST00000425687 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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TBXAS1-206ENST00000425687 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.71■■■□□ 2.19
TBXAS1-206ENST00000425687 CEP170Q5SW79 1584 aa28.65■■■□□ 2.18
TBXAS1-206ENST00000425687 KIF21BO75037 1637 aa28.63■■■□□ 2.17
TBXAS1-206ENST00000425687 NUP160Q12769 1436 aa28.62■■■□□ 2.17
TBXAS1-206ENST00000425687 OSCARQ8IYS5 282 aa28.59■■■□□ 2.17
TBXAS1-206ENST00000425687 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.58■■■□□ 2.17
TBXAS1-206ENST00000425687 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.54■■■□□ 2.16
TBXAS1-206ENST00000425687 GOLGA3Q08378 1498 aa28.49■■■□□ 2.15
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