Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms