Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LAMTOR3Q9UHA4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms