Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LY9Q9HBG7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY9Q9HBG7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms