Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms