Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CRTC2-201ENST00000303569 2290 ntTSL 521.9■■□□□ 1.14e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.054e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CRTC2-207ENST00000487235 2263 ntTSL 213.07□□□□□ -0.324e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CRTC2-204ENST00000461638 2343 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.534e-8■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 OSBPL10-203ENST00000429492 7723 ntTSL 28.38□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.836e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 STAG1-207ENST00000483235 5206 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.846e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.216e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 STAG1-208ENST00000487065 2914 ntTSL 1 (best)7.25□□□□□ -1.256e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.296e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-15■■■■□ 23
PCBP2Q15366 KHSRP-212ENST00000600480 851 ntTSL 214.86□□□□□ -0.031e-15■■■■□ 23
PCBP2Q15366 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 23
PCBP2Q15366 METTL22-202ENST00000381920 4984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 EIF1AD-204ENST00000526451 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 23
PCBP2Q15366 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ZNF561-201ENST00000302851 4693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.886e-10■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ZNF561-209ENST00000444802 912 ntTSL 58.03□□□□□ -1.126e-10■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.276e-10■■■■□ 23
PCBP2Q15366 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-32■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ITPA-205ENST00000460676 488 ntTSL 38.96□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 23
PCBP2Q15366 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.754e-6■■■■□ 23
PCBP2Q15366 NCLN-204ENST00000588428 1080 ntTSL 519.71■□□□□ 0.754e-6■■■■□ 23
PCBP2Q15366 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.113e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.937e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.427e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 PCCA-214ENST00000637358 1533 ntTSL 56.47□□□□□ -1.378e-11■■■■□ 23
PCBP2Q15366 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.94■■□□□ 1.266e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 519.59■□□□□ 0.732e-22■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-22■■■■□ 23
PCBP2Q15366 MIDN-205ENST00000591302 523 ntTSL 217.79■□□□□ 0.446e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.082e-22■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-22■■■■□ 23
PCBP2Q15366 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-22■■■■□ 23
PCBP2Q15366 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 311.63□□□□□ -0.552e-22■■■■□ 23
PCBP2Q15366 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-22■■■■□ 23
PCBP2Q15366 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.337e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 DDX18-202ENST00000415038 644 ntTSL 53.43□□□□□ -1.867e-7■■■■□ 23
PCBP2Q15366 CDHR3-207ENST00000470188 2199 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-8■■■■□ 23
PCBP2Q15366 CDHR3-213ENST00000488386 540 ntTSL 35.45□□□□□ -1.542e-8■■■■□ 23
PCBP2Q15366 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 MLLT3-206ENST00000475957 2059 ntTSL 213.79□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.048e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.228e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 219.72■□□□□ 0.758e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.328e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.18e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 44.78□□□□□ -1.645e-12■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.234e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.59e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-217ENST00000520254 579 ntTSL 418.05■□□□□ 0.489e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 317.6■□□□□ 0.419e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-221ENST00000522361 367 ntTSL 417.45■□□□□ 0.389e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 417.12■□□□□ 0.339e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 516.96■□□□□ 0.319e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 516.4■□□□□ 0.229e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.229e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.189e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.149e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 515.49■□□□□ 0.079e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 315.3■□□□□ 0.049e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.039e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 514.99□□□□□ -0.019e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.459e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.79e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 47.99□□□□□ -1.139e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.249e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 56.58□□□□□ -1.369e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 55.96□□□□□ -1.469e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 35.7□□□□□ -1.59e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 44.95□□□□□ -1.629e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.759e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 23.54□□□□□ -1.849e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 AC025283.2-202ENST00000575785 560 ntTSL 410.28□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 SCAMP5-203ENST00000562212 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 SCAMP5-201ENST00000361900 3427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.815e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)20.73■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 22.9
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