Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN8P56748 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms