Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E9PBE3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E9PBE3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
E9PBE3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms