Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms