Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NSMCE2Q96MF7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms