Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms