Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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