Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDRT1O95170 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms