Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDRT1O95170 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDRT1O95170 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDRT1O95170 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDRT1O95170 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDRT1O95170 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDRT1O95170 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDRT1O95170 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDRT1O95170 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDRT1O95170 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDRT1O95170 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDRT1O95170 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDRT1O95170 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDRT1O95170 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDRT1O95170 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDRT1O95170 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDRT1O95170 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDRT1O95170 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDRT1O95170 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDRT1O95170 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDRT1O95170 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDRT1O95170 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDRT1O95170 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDRT1O95170 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDRT1O95170 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDRT1O95170 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDRT1O95170 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDRT1O95170 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDRT1O95170 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDRT1O95170 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDRT1O95170 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDRT1O95170 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDRT1O95170 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDRT1O95170 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDRT1O95170 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDRT1O95170 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDRT1O95170 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDRT1O95170 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDRT1O95170 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDRT1O95170 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDRT1O95170 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDRT1O95170 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDRT1O95170 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDRT1O95170 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDRT1O95170 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDRT1O95170 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDRT1O95170 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDRT1O95170 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDRT1O95170 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDRT1O95170 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDRT1O95170 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDRT1O95170 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDRT1O95170 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDRT1O95170 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDRT1O95170 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDRT1O95170 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDRT1O95170 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDRT1O95170 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDRT1O95170 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDRT1O95170 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDRT1O95170 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDRT1O95170 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDRT1O95170 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDRT1O95170 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDRT1O95170 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDRT1O95170 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDRT1O95170 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDRT1O95170 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDRT1O95170 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDRT1O95170 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDRT1O95170 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDRT1O95170 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDRT1O95170 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDRT1O95170 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDRT1O95170 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDRT1O95170 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDRT1O95170 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDRT1O95170 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDRT1O95170 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDRT1O95170 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDRT1O95170 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDRT1O95170 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDRT1O95170 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDRT1O95170 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDRT1O95170 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDRT1O95170 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDRT1O95170 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDRT1O95170 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDRT1O95170 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDRT1O95170 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDRT1O95170 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDRT1O95170 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms