Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.255e-8■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 DOCK2-205ENST00000519628 631 ntTSL 36.32□□□□□ -1.44e-6■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 416.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 ATXN2-204ENST00000392645 2842 ntTSL 214.52□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 114.5
SF3B1O75533 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 TCF20-204ENST00000515426 633 ntTSL 518.88■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 BABAM2-205ENST00000379629 865 ntTSL 36.68□□□□□ -1.346e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 230.41■■■□□ 2.464e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 321.4■■□□□ 1.024e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 316.24■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 327.07■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 527.07■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.176e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.236e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.256e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.576e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 MXD1-204ENST00000435990 860 ntTSL 313.72□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 114.4
SF3B1O75533 RANBP10-208ENST00000602887 683 ntTSL 328.31■■■□□ 2.123e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-205ENST00000602638 1248 ntTSL 228.09■■■□□ 2.093e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-207ENST00000602815 577 ntTSL 428.09■■■□□ 2.093e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-203ENST00000602506 2756 ntTSL 218.66■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RANBP10-204ENST00000602525 1353 ntTSL 213.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 CCNT2-206ENST00000446247 663 ntTSL 517.46■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 CCNT2-204ENST00000419781 5414 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 CCNT2-208ENST00000452839 2363 ntTSL 211.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RAB31-205ENST00000578734 783 ntTSL 326.01■■□□□ 1.755e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RAB31-210ENST00000581109 469 ntTSL 326.01■■□□□ 1.755e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.245e-6■■■■■ 114.3
SF3B1O75533 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 317.71■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.484e-7■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.893e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-207ENST00000547283 555 ntTSL 422.82■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-226ENST00000551430 751 ntTSL 322.82■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 14e-7■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 B4GALT2-206ENST00000485678 943 ntTSL 320.92■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-219ENST00000550655 589 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-214ENST00000548849 1028 ntTSL 318.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 ZNF783-203ENST00000476295 2346 ntTSL 218.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 FASTK-210ENST00000478477 826 ntTSL 317.43■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-229ENST00000551936 744 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-230ENST00000551968 542 ntTSL 415.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CLUH-210ENST00000574426 3844 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.24■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-231ENST00000552222 555 ntTSL 415.16■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 ZNF783-201ENST00000378052 2876 ntTSL 214.83□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-228ENST00000551473 797 ntTSL 313.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-221ENST00000550734 747 ntTSL 512.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-208ENST00000547298 656 ntTSL 312.61□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-223ENST00000551137 903 ntTSL 312.6□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 WWC2-202ENST00000427431 6373 ntTSL 210.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-218ENST00000550159 646 ntTSL 510.35□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-211ENST00000548041 561 ntTSL 49.35□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-206ENST00000546930 568 ntTSL 48.92□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-216ENST00000549221 553 ntTSL 48.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 WWC2-203ENST00000438543 3824 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-225ENST00000551253 676 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-233ENST00000552688 580 ntTSL 47.6□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 SZT2-201ENST00000357658 1601 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 SZT2-212ENST00000638631 2574 ntTSL 519.88■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 BAIAP2L1-202ENST00000462558 1250 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 SZT2-203ENST00000406439 2198 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.63e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.643e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 114.2
SF3B1O75533 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 114.1
SF3B1O75533 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 114.1
SF3B1O75533 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 114.1
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1669.5 ms