RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.18■■■■□ 3.22
CS-231ENST00000552222 ABCC9O60706 1549 aa32.77■■■□□ 2.84
CS-231ENST00000552222 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.69■■■□□ 2.66
CS-231ENST00000552222 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.57■■■□□ 2.64
CS-231ENST00000552222 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.59■■■□□ 2.49
CS-231ENST00000552222 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.487e-9■■□□□ 13
CS-231ENST00000552222 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.29■■■□□ 2.44
CS-231ENST00000552222 NACADO15069 1562 aa30.18■■■□□ 2.42
CS-231ENST00000552222 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.02■■■□□ 2.4
CS-231ENST00000552222 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.91■■■□□ 2.38
CS-231ENST00000552222 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.49■■■□□ 2.31
CS-231ENST00000552222 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.45■■■□□ 2.31
CS-231ENST00000552222 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.4■■■□□ 2.3
CS-231ENST00000552222 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.27■■■□□ 2.28
CS-231ENST00000552222 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CS-231ENST00000552222 SCRIBQ14160 1630 aa29.13■■■□□ 2.25
CS-231ENST00000552222 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.04■■■□□ 2.24
CS-231ENST00000552222 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CS-231ENST00000552222 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.82■■■□□ 2.2
CS-231ENST00000552222 CUX2O14529 1486 aa28.27■■■□□ 2.12
CS-231ENST00000552222 ERCC6Q03468 1493 aa28.21■■■□□ 2.11
CS-231ENST00000552222 NESP48681 1621 aa28■■■□□ 2.07
CS-231ENST00000552222 NCAPD3P42695 1498 aa27.95■■■□□ 2.06
CS-231ENST00000552222 TRIM41Q8WV44 630 aa27.87■■■□□ 2.05
CS-231ENST00000552222 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.84■■■□□ 2.05
CS-231ENST00000552222 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CS-231ENST00000552222 HMGXB3Q12766 1538 aa27.6■■■□□ 2.01
CS-231ENST00000552222 SMARCA4P51532 1647 aa27.59■■■□□ 2.01
CS-231ENST00000552222 SMARCA2P51531 1590 aa27.58■■■□□ 2.01
CS-231ENST00000552222 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CS-231ENST00000552222 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.46■■□□□ 1.99
CS-231ENST00000552222 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.37■■□□□ 1.97
CS-231ENST00000552222 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.27■■□□□ 1.96
CS-231ENST00000552222 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
CS-231ENST00000552222 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.22■■□□□ 1.95
CS-231ENST00000552222 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.21■■□□□ 1.95
CS-231ENST00000552222 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.14■■□□□ 1.94
CS-231ENST00000552222 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.11■■□□□ 1.93
CS-231ENST00000552222 WDR62O43379 1518 aa27.08■■□□□ 1.93
CS-231ENST00000552222 OSCARQ8IYS5 282 aa26.99■■□□□ 1.91
CS-231ENST00000552222 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.87■■□□□ 1.89
CS-231ENST00000552222 WIZO95785 1651 aa26.86■■□□□ 1.89
CS-231ENST00000552222 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.84■■□□□ 1.89
CS-231ENST00000552222 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-231ENST00000552222 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-231ENST00000552222 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.76■■□□□ 1.87
CS-231ENST00000552222 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CS-231ENST00000552222 CFTRP13569 1480 aa26.63■■□□□ 1.85
CS-231ENST00000552222 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CS-231ENST00000552222 ARHGEF11O15085 1522 aa26.58■■□□□ 1.85
CS-231ENST00000552222 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.56■■□□□ 1.84
CS-231ENST00000552222 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CS-231ENST00000552222 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CS-231ENST00000552222 IFT140Q96RY7 1462 aa26.34■■□□□ 1.81
CS-231ENST00000552222 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CS-231ENST00000552222 ARAP1Q96P48 1450 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-231ENST00000552222 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CS-231ENST00000552222 TOPBP1Q92547 1522 aa26.25■■□□□ 1.79
CS-231ENST00000552222 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.792e-12■■■■□ 25.7
CS-231ENST00000552222 FBLN2P98095 1184 aa26.24■■□□□ 1.79
CS-231ENST00000552222 CHD1O14646 1710 aa26.22■■□□□ 1.79
CS-231ENST00000552222 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.16■■□□□ 1.78
CS-231ENST00000552222 PRDM2Q13029 1718 aa26.15■■□□□ 1.78
CS-231ENST00000552222 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CS-231ENST00000552222 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CS-231ENST00000552222 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.01■■□□□ 1.75
CS-231ENST00000552222 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26■■□□□ 1.75
CS-231ENST00000552222 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CS-231ENST00000552222 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CS-231ENST00000552222 ABCC8Q09428 1581 aa25.92■■□□□ 1.74
CS-231ENST00000552222 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-231ENST00000552222 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.87■■□□□ 1.73
CS-231ENST00000552222 SOGA1O94964 1423 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-231ENST00000552222 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CS-231ENST00000552222 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-231ENST00000552222 SYNJ1O43426 1573 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-231ENST00000552222 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-231ENST00000552222 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-231ENST00000552222 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CS-231ENST00000552222 GRIN2BQ13224 1484 aa25.6■■□□□ 1.69
CS-231ENST00000552222 SYNJ2O15056 1496 aa25.6■■□□□ 1.69
CS-231ENST00000552222 CUX1P39880 1505 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-231ENST00000552222 PBRM1Q86U86 1689 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-231ENST00000552222 WDR97A6NE52 1622 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-231ENST00000552222 CEP170Q5SW79 1584 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-231ENST00000552222 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-231ENST00000552222 GRIN2AQ12879 1464 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-231ENST00000552222 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-231ENST00000552222 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.27■■□□□ 1.64
CS-231ENST00000552222 NUP160Q12769 1436 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-231ENST00000552222 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CS-231ENST00000552222 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.22■■□□□ 1.63
CS-231ENST00000552222 ADAMTS12P58397 1594 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-231ENST00000552222 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-231ENST00000552222 SHROOM2Q13796 1616 aa25.17■■□□□ 1.62
CS-231ENST00000552222 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CS-231ENST00000552222 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-231ENST00000552222 JPH4Q96JJ6 628 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-231ENST00000552222 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.05■■□□□ 1.6
CS-231ENST00000552222 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
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