Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF22A3QJZ6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms