Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CADM1Q9BY67 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms