Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms