Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVOPQ8N4V2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms