Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A3P43003 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms